Jak to działa

Poniżej wyjaśnimy w jaki sposób to wszystko funkcjonuje. W skrócie - stworzyliśmy robota, który robi większość czynności za nas, korzystając z otwartych informacji polskiej Wikipedii.

Tworzenie listy roślin występujących w Polsce

Robot czyta nazwy łacińskie roślin wyszczególnionych w następujących artykułach z Wikipedii:

Sprawdzanie poprawności nazw i poszukiwanie synonimów

Po zebraniu nazw łacińskich roślin, robot korzysta z bazy The Plant List sprawdzając, czy dana nazwa jest nazwą główną, czy synonimem. Jeśli okazuje się synonimem - korzysta z nazwy głównej. .

Pobieranie informacji z Wikipedii

Robot ściąga artykuły dla roślin obecnych w Wikipedii, a następnie przetwarza je tak, by uzyskać jak najwięcej informacji na temat morfologii. Uzyskane w ten sposób cechy grupuje w sposób zdefiniowany przez nas i dodaje do bazy danych atlasu.

Następnie robot poszukuje taksonomii danej rośliny w bazie GBIF i dodaje wynik do bazy atlasu. W ostatnim etapie, korzystając z API Wikipedii, robot pobiera zdjęcia roślin z polskiej Wikipedii oraz z Wikimedia. Informacje o autorstwie zdjęć i zasadach udostępniania są pobierane z użyciem API wmflabs.

Dodatkowe zdjęcia robot pobiera ze strony http://www.actaplantarum.org/acta/galleria.php udostępnianych na zasadach Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License oraz z http://www.biolib.de udostępniającej skany z książek botanicznych, które przeszły do Domeny Publicznej.

Potwierdzanie informacji

Wpisy dotyczące nowych roślin są przeglądane przez człowieka, cechy charakterystyczne są na tym etapie ewentualnie modyfikowane. Zduplikowane zdjęcia również są usuwane. Uwaga: nie jesteśmy w stanie na bieżąco przeglądać bazy (zapraszamy do współpracy!), dlatego zawsze podchodź do prezentowanych tu informacji ostrożnie i potwierdź w innych źródłach.

Zawartość bazy danych

Baza zawiera 2386 roślin rosnących dziko bądź w uprawie na terenie Polski. Baza zawiera również 81369 miejsc występowania roślin z bazy GBIF oraz 448 wprowadzonych przez Użytkowników atlasu. Dla łatwiejszej identyfikacji, baza zawiera 68330 zdjęć (+ 3221 dodanych przez Użytkowników) różnych części roślin udostępnianych w Internecie na zasadach Creative Commons bądź będących w domenie publicznej.
Nie wszystkie rośliny występują w bazie: z informacji o roślinach występujących w Polsce [1, 2, 3] wynika, że brakuje nam około 950 roślin (zobacz poniżej jak możesz to zmienić), co więcej - w przypadku 68 roślin nie posiadamy zdjęć co znacznie utrudnia ich identyfikację (zobacz poniżej jak możesz to zmienić). Wierzymy, że z upływem czasu baza będzie systematycznie uzupełniana, m.in. dzięki Wam.

Histogram liczby cech przypisanych roślinom

Statystyki poszczególnych cech przypisanych roślinom

GrupaCecha# roślin
ogólne roślina barwierska 26
ogólne roślina nadwodna 1
ogólne pnącze 32
ogólne roślina ozdobna 674
ogólne krzewinka 33
ogólne roślina inwazyjna 72
ogólne roślina ekspansywna 64
ogólne drzewo 274
ogólne chwast 225
ogólne krzew 210
ogólne roślina pionierska 15
ogólne roślina wodna 111
ogólne roślina chroniona 110
ogólne roślina trująca 299
ogólne roślina użytkowa 1062
ogólne roślina lecznicza 458
ogólne roślina jadalna 262
ogólne bylina 1208
ogólne roślina pyłkodajna 125
ogólne roślina miododajna 173
cechy kory kora z przetchlinkami 1
barwa kwiatów płatki pomarańczowe 54
barwa kwiatów płatki brudnobiałe 9
barwa kwiatów płatki purpurowe 89
barwa kwiatów płatki kremowe 39
barwa kwiatów płatki białe 778
barwa kwiatów płatki liliowe 33
barwa kwiatów płatki różowe 376
barwa kwiatów płatki szafirowe 2
barwa kwiatów płatki czerwone 336
barwa kwiatów płatki zielonkawe 85
barwa kwiatów płatki fioletowe 320
barwa kwiatów płatki niebieskie 177
barwa kwiatów płatki żółte 721
barwa kwiatów płatki zielone 55
barwa kwiatów płatki brązowe 92
barwa kwiatów rurkowatych żółta 3
barwa kwiatów rurkowatych pomarańczowa 1
barwa kwiatów rurkowatych rdzawa 1
typ kielicha wolnodziałkowy 3
typ kielicha dzwonkowaty 2
typ kielicha rurkowaty 1
typ kielicha wargowy 2
typ kielicha beczułkowaty 1
kształt korony wierzchotkowata wieloramienna 2
kształt korony grono 227
kształt korony sierpik 8
kształt korony wiecha 36
kształt korony kłos 314
kształt korony kolba 3
kształt korony kotka 1
kształt korony baldaszek 1
kształt korony główka 134
kształt korony wiecha złożona 6
kształt korony korona o płatkach zrośnietych 5
kształt korony grono złożone 5
kształt korony korona o płatkach wolnych 6
kształt korony kłos złożony 2
kształt korony koszyczek 227
kształt korony kwiaty zwisające 140
kształt korony podbaldachy 45
kształt korony baldach złożony 29
kształt korony baldachogrono 52
kształt korony kwiatostan 614
kształt korony skrętek 1
kształt korony baldachy 87
kształt korony wierzchotkowata dwuramienna 12
kształt korony kwiat złożony 31
obecność miodników tak 3
obecność miodników nie 1
liczba płatków płatki trzy i mniej 42
liczba płatków płatki cztery 82
liczba płatków płatków pięć 218
liczba płatków płatków sześć i więcej 17
pręciki jednakowej długości 2
pręciki dwusilne 1
pręciki rurka 2
symetria kwiatu grzbiecista, wargowa 10
symetria kwiatu grzbiecista, języczkowata (5-ząbkowa) 19
symetria kwiatu grzbiecista, nibyjęzyczkowata (3-ząbkowa) 1
symetria kwiatu kwiat promienisty 89
symetria kwiatu grzbiecista, jednowargowa 2
symetria kwiatu grzbiecista, motylkowata 67
symetria kwiatu grzbiecista, hełmowata 3
symetria kwiatu grzbiecista, z ostrogą 82
symetria kwiatu kwiat asymetryczny 1
symetria kwiatu symetria talerzykowata 8
symetria kwiatu symetria beczułkowata 9
symetria kwiatu kwiat grzbiecisty 130
symetria kwiatu kwiat motylkowy 82
symetria kwiatu symetria dzwonkowata 99
symetria kwiatu symetria lejkowata 45
symetria kwiatu symetria rurkowata 107
symetria kwiatu symetria kółkowa 10
typ kwiatu pręcikowy 3
typ kwiatu słupkowy 5
typ kwiatu obupłciowy 8
znamiona słupka dwudzielne 1
znamiona słupka wielodzielne 1
kształt blaszki liście okrągłe 95
kształt blaszki liście eliptycznolancetowate 8
kształt blaszki liście lancetowate 715
kształt blaszki liście eliptyczne 134
kształt blaszki liście nerkowate 40
kształt blaszki liście romboidalne 11
kształt blaszki liście odwrotnie jajowate 118
kształt blaszki liście wąskie i wydłużone 293
kształt blaszki liście trójkątne 83
kształt blaszki liście klinowate 79
kształt blaszki liście najszersze w połowie długości 37
kształt blaszki liście łopatkowate 51
kształt blaszki liście najszersze przy końcu 182
kształt blaszki liście odwrotnie sercowate 3
kształt blaszki liście najszersze przy nasadzie 88
kształt blaszki liście strzałkowate 21
kształt blaszki liście oszczepowate 16
kształt blaszki igły 61
kształt blaszki liście sercowate 208
kształt blaszki bez zielonych liści 2
kształt blaszki liście szpilkowate 2
kształt blaszki liście jajowate 806
kształt blaszki liście równowąske 276
brzeg liścia całobrzegi 9
brzeg liścia piłkowany 3
brzeg liścia karbowany 3
brzeg liścia ząbkowany 9
brzeg liścia falisty 1
brzeg liścia orzęsiony 2
brzeg liścia podwójnie piłkowany 1
kolor liścia żywozielone 3
nasada sercowata 4
nasada strzałkowata 1
nasada klinowata 1
nasada zaokrąglona 2
ogonek liściowy spłaszczony 1
ogonek liściowy rynienkowaty 1
liście przykwiatowe kieliszek (pod kielichem) 2
liście przykwiatowe podkwiatki 2
liście przykwiatowe okrywy koszyczków 3
liście przykwiatowe pokrywki 1
przylistki nitkowate 1
przylistki z nektarnikami 1
przylistki liściaste 2
szczyt tępy 3
szczyt ostry 3
szczyt zaostrzony 4
typ liści liść prosty 14
typ liści dłoniastozłożony 1
typ liści parzyście pierzastozłożony 1
typ liści nieparzyście pierzastozłożony 6
ulistnienie ząbkowany 365
ulistnienie karbowany 149
ulistnienie pojedyncze ząbkowane 2
ulistnienie całobrzegie 271
ulistnienie piłkowane 221
ulistnienie kolczasto-ząbkowane 35
ulistnienie liście pierzaste 399
ulistnienie liście różyczkowe 37
ulistnienie liście skrętoległe 270
ulistnienie naprzeciwległe 230
ulistnienie okółkowe 17
ulistnienie naprzemianległe 42
ulistnienie dłoniastodzielne 12
ulistnienie liście owłosione 643
ulistnienie ogonek liściowy obecny 457
ulistnienie bezogonkowe 340
ulistnienie u dołu łodygi lub odziomkowe 356
ulistnienie wcinane (wrębne, sieczne i klapowane) 285
unerwienie równoległe 1
unerwienie pierzaste 16
wcięcia blaszki pięcioklapowe 1
wcięcia blaszki trójklapowe 2
kolor nasion żółte 4
kolor nasion brązowe 7
kolor nasion czarne 3
rozsiewanie nasion ballochoria 3
rozsiewanie nasion anemochoria 3
rozsiewanie nasion antropochoria 1
rozsiewanie nasion myrmekochoria 3
rozsiewanie nasion zoochoria 1
wielkość nasion poniżej 4mm 9
kolor owoców szare 24
kolor owoców fioletowe 12
kolor owoców białe 59
kolor owoców żółte 129
kolor owoców pomarańczowe 25
kolor owoców purpurowe 6
kolor owoców zielone 105
kolor owoców niebieskie 17
kolor owoców czarne 116
kolor owoców brązowe 211
kolor owoców czerwone 147
rodzaj owoców puch kielichowy 114
rodzaj owoców orzechy 207
rodzaj owoców łuszczyna 80
rodzaj owoców rozłupki 142
rodzaj owoców mieszek 44
rodzaj owoców pestkowiec 59
rodzaj owoców torebki 484
rodzaj owoców skrzydełka 100
rodzaj owoców jagoda 75
rodzaj owoców kuliste 276
rodzaj owoców niełupki 250
rodzaj owoców duże 18
rodzaj owoców ziarniak 56
rodzaj owoców strąki 101
powierzchnia owocu pomarszczona 30
powierzchnia owocu żeberkowana 55
powierzchnia owocu gładka 92
powierzchnia owocu szorstka 11
powierzchnia owocu owłosiona 202
powierzchnia owocu kanciasta 47
powierzchnia owocu kolczasta 14
sok pędu sok mleczny 18
wygląd łodygi łodyga pełzająca 216
wygląd łodygi łodyga trójkanciasta 47
wygląd łodygi łodyga czterokanciasta 69
wygląd łodygi łodyga gałęzista 688
wygląd łodygi łodyga szorstka 108
wygląd łodygi łodyga owłosiona 653
wygląd łodygi łodyga kolczasta 14
wygląd łodygi łodyga żebrowana 9
wygląd łodygi łodyga gładka 351
wygląd łodygi łodyga wzniesiona 605
wygląd łodygi łodyga prosta 1
wygląd łodygi łodyga omszona 52
szacowana wysokość łodygi do kostki (0 < x < 15 cm) 122
szacowana wysokość łodygi od kostki do kolana (15< x <60 cm) 13
szacowana wysokość łodygi od kolana do pasa (60 < x < 100 cm) 358
szacowana wysokość łodygi od pasa do wysokości człowieka (100 < x < 200 cm) 225
szacowana wysokość łodygi wyższa od człowieka (> 200 cm) 267
zapach łodygi zapach aromatyczny 19
zapach łodygi zapach czosnkowy 2
zapach łodygi zapach nieprzyjemny 11
pora kwitnienia grudzień 2
pora kwitnienia luty 8
pora kwitnienia marzec 66
pora kwitnienia kwiecień 229
pora kwitnienia maj 611
pora kwitnienia czerwiec 1005
pora kwitnienia lipiec 1077
pora kwitnienia sierpień 848
pora kwitnienia wrzesień 430
pora kwitnienia październik 127
pora kwitnienia listopad 9

Aktualizacja bazy danych

Korzystając z powyżej przedstawionego schematu, robot sprawdza co tydzień czy pojawiły się nowe rośliny w polskiej Wikipedii oraz czy obecne już w naszej bazie rośliny nie zostały zaktualizowane - jeśli tak, nanosi poprawki w atlasie.

Jak wynika z powyższego opisu, by uaktualnić bazę atlasu należy uaktualnić polską Wikipedię. Zachęcamy do samodzielnego dodawania artykułów o polskich roślinach (można to zrobić bez zakładania konta) - nie tylko wzbogacisz Wikipedię, ale jednocześnie atlas. Oczywiście Wikipedia (czy bardziej ogólnie - Wikimedia) umożliwia również dodawanie zdjęć roślin.

Jeśli jesteś zainteresowana/y dodaniem nowych roślin do Wikipedii, poniżej przygotowaliśmy spis pozycji, które prawdopodobnie występują w Polsce, ale nie występują w Wikipedii:

Warto pamiętać, że polscy Wikipedyści tworzą artykuły dotyczące roślin według pewnego schematu, który jest opisany tutaj.

Jeśli brakuje w atlasie rośliny, która jest obecna w Wikipedii, możesz albo nam o tym napisać, albo uzupełnić któryś z poniższych spisów roślin w Wikipedii:

Rozpoznawanie roślin na podstawie zdjęć

Rozpoznawanie wykorzystuje sieć neuronową resnet 101 wytrenowaną na podstawie zdjęć z atlasu za pomocą mxnet. Model można pobrać tutaj (licencja GPL).

Dokładność algorytmu rozpoznawania roślin na podstawie zdjęcia*:

w 77%przypadków roślina ze zdjęcia pojawia sięjako pierwsza na liście wyników
w 91%w pierwszej piątce
* - wyniki dla 25642 losowych, ogólnodostępnych w internecie zdjęć roślin, po wyłączeniu zdjęć użytych do trenowania sieci neuronowej (validation set, dlatego w rzeczywistości dokładność będzie nieznacznie mniejsza)

Licencja

Zawartość atlasu udostępniana jest na zasadach licencji Creative Commons BY-SA 3.0, ponieważ pochodzą one z Wikipedii. Zdjęcia natomiast opatrzone są informacją o licencji i autorstwie przy powiększeniu ich do pełnego rozmiaru. Jest to zazwyczaj licencja z rodziny Creative Commons lub domena publiczna. Jeśli Twoje zdjęcie znalazło się tu wbrew licencji, zgłoś to nam korzystając z przycisku Zgłoś błąd po prawej stronie okna.

Kod źródłowy

Kod źródłowy atlasu roślin jak i aplikacji na telefony mobilne można pobrać z repozytorium. Kod udostępniany jest na wolnej licencji GPL.