Jak to działa

Poniżej wyjaśnimy w jaki sposób to wszystko funkcjonuje. W skrócie - stworzyliśmy robota, który robi większość czynności za nas, korzystając z otwartych informacji polskiej Wikipedii.

Tworzenie listy roślin występujących w Polsce

Robot czyta nazwy łacińskie roślin wyszczególnionych w następujących artykułach z Wikipedii:

Sprawdzanie poprawności nazw i poszukiwanie synonimów

Po zebraniu nazw łacińskich roślin, robot korzysta z bazy The Plant List sprawdzając, czy dana nazwa jest nazwą główną, czy synonimem. Jeśli okazuje się synonimem - korzysta z nazwy głównej. .

Pobieranie informacji z Wikipedii

Robot ściąga artykuły dla roślin obecnych w Wikipedii, a następnie przetwarza je tak, by uzyskać jak najwięcej informacji na temat morfologii. Uzyskane w ten sposób cechy grupuje w sposób zdefiniowany przez nas i dodaje do bazy danych atlasu.

Następnie robot poszukuje taksonomii danej rośliny w bazie GBIF i dodaje wynik do bazy atlasu. W ostatnim etapie, korzystając z API Wikipedii, robot pobiera zdjęcia roślin z polskiej Wikipedii oraz z Wikimedia. Informacje o autorstwie zdjęć i zasadach udostępniania są pobierane z użyciem API wmflabs.

Dodatkowe zdjęcia robot pobiera ze strony http://www.actaplantarum.org/acta/galleria.php udostępnianych na zasadach Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 International License oraz z http://www.biolib.de udostępniającej skany z książek botanicznych, które przeszły do Domeny Publicznej.

Potwierdzanie informacji

Wpisy dotyczące nowych roślin są przeglądane przez człowieka, cechy charakterystyczne są na tym etapie ewentualnie modyfikowane. Zduplikowane zdjęcia również są usuwane. Uwaga: nie jesteśmy w stanie na bieżąco przeglądać bazy (zapraszamy do współpracy!), dlatego zawsze podchodź do prezentowanych tu informacji ostrożnie i potwierdź w innych źródłach.

Zawartość bazy danych

Baza zawiera 2447 roślin rosnących dziko bądź w uprawie na terenie Polski. Baza zawiera również 88369 miejsc występowania roślin z bazy GBIF oraz 463 wprowadzonych przez Użytkowników atlasu. Dla łatwiejszej identyfikacji, baza zawiera 69837 zdjęć (+ 3323 dodanych przez Użytkowników) różnych części roślin udostępnianych w Internecie na zasadach Creative Commons bądź będących w domenie publicznej.
Nie wszystkie rośliny występują w bazie: z informacji o roślinach występujących w Polsce [1, 2, 3] wynika, że brakuje nam około 912 roślin (zobacz poniżej jak możesz to zmienić), co więcej - w przypadku 80 roślin nie posiadamy zdjęć co znacznie utrudnia ich identyfikację (zobacz poniżej jak możesz to zmienić). Wierzymy, że z upływem czasu baza będzie systematycznie uzupełniana, m.in. dzięki Wam.

Histogram liczby cech przypisanych roślinom

Statystyki poszczególnych cech przypisanych roślinom

GrupaCecha# roślin
ogólne bylina 1242
ogólne roślina zimozielona 2
ogólne roślina pyłkodajna 127
ogólne roślina miododajna 172
ogólne roślina górska 1
ogólne roślina barwierska 24
ogólne roślina nadwodna 1
ogólne pnącze 32
ogólne roślina żywicielska 1
ogólne krzewinka 33
ogólne roślina ozdobna 675
ogólne roślina inwazyjna 72
ogólne roślina ekspansywna 65
ogólne drzewo 275
ogólne chwast 225
ogólne krzew 210
ogólne roślina pionierska 15
ogólne roślina wodna 123
ogólne kenofit 1
ogólne roślina chroniona 110
ogólne roślina trująca 304
ogólne roślina użytkowa 1069
ogólne roślina lecznicza 459
ogólne roślina jadalna 266
cechy kory kora z przetchlinkami 1
cechy korony wysoko rozgałęziona 1
forma życiowa wg Raunkiæra megafanerofit 3
forma życiowa wg Raunkiæra hemikryptofit 2
forma życiowa wg Raunkiæra hydrofit 1
forma życiowa wg Raunkiæra helofit 1
kolor igieł ciemnozielone 1
ułożenie igieł równomiernie na gałęziach 1
wierzchołek igieł ostry 1
wygląd igieł sztywne 1
wygląd igieł na przekroju kwadratowe 1
wygląd igieł krótkie 1
wygląd igieł bardzo kłujące 1
kolor kory brunatnoszara 1
kolor kory brunatnoczerwonawa 1
kolor kory szara 1
spekania kory łuskowate 1
kształt Korzenie podziemne 3
barwa kwiatów płatki białe 789
barwa kwiatów płatki różowe 381
barwa kwiatów płatki czerwone 345
barwa kwiatów płatki fioletowe 321
barwa kwiatów płatki niebieskie 179
barwa kwiatów płatki żółte 736
barwa kwiatów płatki zielone 56
barwa kwiatów płatki brudnobiałe 9
barwa kwiatów płatki pomarańczowe 58
barwa kwiatów płatki brązowe 96
barwa kwiatów płatki kremowe 39
barwa kwiatów płatki purpurowe 91
barwa kwiatów płatki liliowe 32
barwa kwiatów płatki szafirowe 2
barwa kwiatów płatki zielonkawe 85
barwa kwiatów rurkowatych żółta 1
barwa kwiatów rurkowatych pomarańczowa 1
typ kielicha wolnodziałkowy 2
typ kielicha dzwonkowaty 3
typ kielicha rurkowaty 1
typ kielicha wargowy 1
typ kielicha beczułkowaty 1
kształt korony skrętek 1
kształt korony wierzchotkowata dwuramienna 12
kształt korony koszyczek 237
kształt korony podbaldachy 46
kształt korony wierzchotkowata wieloramienna 2
kształt korony baldachogrono 52
kształt korony grono 230
kształt korony kłos 330
kształt korony korona o płatkach zrośnietych 6
kształt korony sierpik 8
kształt korony kolba 3
kształt korony korona o płatkach wolnych 3
kształt korony wiecha 34
kształt korony kotka 1
kształt korony kwiaty zwisające 141
kształt korony baldaszek 1
kształt korony kwiatostan 613
kształt korony główka 138
kształt korony baldachy 90
kształt korony wiecha złożona 6
kształt korony kwiat złożony 31
kształt korony grono złożone 5
kształt korony kłos złożony 2
kształt korony baldach złożony 29
obecność miodników tak 2
obecność miodników nie 1
pienność roślina jednopienna 1
liczba płatków płatki trzy i mniej 43
liczba płatków płatki cztery 82
liczba płatków płatków pięć 224
liczba płatków płatków sześć i więcej 18
pręciki jednakowej długości 1
pręciki rurka 1
symetria kwiatu kwiat grzbiecisty 134
symetria kwiatu symetria dzwonkowata 100
symetria kwiatu kwiat motylkowy 84
symetria kwiatu symetria lejkowata 45
symetria kwiatu symetria rurkowata 108
symetria kwiatu symetria kółkowa 10
symetria kwiatu grzbiecista, wargowa 8
symetria kwiatu grzbiecista, języczkowata (5-ząbkowa) 20
symetria kwiatu kwiat promienisty 94
symetria kwiatu grzbiecista, nibyjęzyczkowata (3-ząbkowa) 1
symetria kwiatu grzbiecista, jednowargowa 2
symetria kwiatu grzbiecista, motylkowata 69
symetria kwiatu grzbiecista, hełmowata 3
symetria kwiatu grzbiecista, z ostrogą 82
symetria kwiatu kwiat asymetryczny 1
symetria kwiatu symetria talerzykowata 8
symetria kwiatu symetria beczułkowata 9
typ kwiatu pręcikowy 2
typ kwiatu słupkowy 3
typ kwiatu obupłciowy 4
znamiona słupka dwudzielne 1
znamiona słupka wielodzielne 1
kształt blaszki liście wąskie i wydłużone 307
kształt blaszki liście szpilkowate 1
kształt blaszki liście strzałkowate 22
kształt blaszki liście najszersze w połowie długości 39
kształt blaszki liście równowąske 288
kształt blaszki liście oszczepowate 16
kształt blaszki liście najszersze przy końcu 191
kształt blaszki igły 61
kształt blaszki liście eliptycznolancetowate 6
kształt blaszki liście najszersze przy nasadzie 90
kształt blaszki bez zielonych liści 2
kształt blaszki liście eliptyczne 134
kształt blaszki liście romboidalne 11
kształt blaszki liście trójkątne 85
kształt blaszki liście odwrotnie jajowate 118
kształt blaszki liście klinowate 80
kształt blaszki skórzaste 1
kształt blaszki liście sercowate 213
kształt blaszki liście jajowate 821
kształt blaszki liście okrągłe 99
kształt blaszki liście lancetowate 738
kształt blaszki liście łopatkowate 54
kształt blaszki liście nerkowate 40
kształt blaszki liście odwrotnie sercowate 3
brzeg liścia całobrzegi 5
brzeg liścia piłkowany 3
brzeg liścia karbowany 2
brzeg liścia ząbkowany 6
brzeg liścia podwójnie piłkowany 1
kolor liścia żywozielone 4
kolor liścia ciemnozielone 3
nasada sercowata 2
nasada zaokrąglona 1
ogonek liściowy spłaszczony 1
liście przykwiatowe pokrywki 2
liście przykwiatowe kieliszek (pod kielichem) 1
liście przykwiatowe podkwiatki 2
liście przykwiatowe przysadki 2
liście przykwiatowe pokrywy 1
szczyt tępy 2
szczyt ostry 3
szczyt zaostrzony 2
typ liści liść prosty 8
typ liści dłoniastozłożony 1
typ liści nieparzyście pierzastozłożony 6
ulistnienie całobrzegie 280
ulistnienie piłkowane 223
ulistnienie liście pierzaste 407
ulistnienie liście skrętoległe 274
ulistnienie naprzeciwległe 232
ulistnienie okółkowe 17
ulistnienie naprzemianległe 43
ulistnienie liście owłosione 650
ulistnienie ogonek liściowy obecny 468
ulistnienie kolczasto-ząbkowane 36
ulistnienie bezogonkowe 355
ulistnienie u dołu łodygi lub odziomkowe 367
ulistnienie liście różyczkowe 36
ulistnienie wcinane (wrębne, sieczne i klapowane) 294
ulistnienie ząbkowany 374
ulistnienie karbowany 149
ulistnienie dłoniastodzielne 13
ulistnienie pojedyncze ząbkowane 2
unerwienie równoległe 1
unerwienie pierzaste 9
wcięcia blaszki trójklapowe 1
wcięcia blaszki pięcioklapowe 1
kolor nasion czarne 3
kolor nasion czerwone 1
kolor nasion żółte 4
kolor nasion brązowe 6
rozsiewanie nasion anemochoria 4
rozsiewanie nasion antropochoria 1
rozsiewanie nasion myrmekochoria 1
rozsiewanie nasion zoochoria 1
rozsiewanie nasion ballochoria 1
wielkość nasion poniżej 4mm 4
kolor owoców zielone 105
kolor owoców niebieskie 17
kolor owoców czarne 121
kolor owoców brązowe 209
kolor owoców czerwone 147
kolor owoców fioletowe 13
kolor owoców szare 25
kolor owoców białe 63
kolor owoców pomarańczowe 25
kolor owoców żółte 129
kolor owoców purpurowe 6
rodzaj owoców mieszek 46
rodzaj owoców puch kielichowy 115
rodzaj owoców torebki 496
rodzaj owoców jagoda 75
rodzaj owoców kuliste 283
rodzaj owoców niełupki 266
rodzaj owoców duże 19
rodzaj owoców ziarniak 56
rodzaj owoców strąki 104
rodzaj owoców orzechy 214
rodzaj owoców pestkowiec 60
rodzaj owoców skrzydełka 107
rodzaj owoców łuszczyna 85
rodzaj owoców rozłupki 144
powierzchnia owocu kolczasta 15
powierzchnia owocu pomarszczona 31
powierzchnia owocu żeberkowana 56
powierzchnia owocu gładka 93
powierzchnia owocu szorstka 11
powierzchnia owocu owłosiona 206
powierzchnia owocu kanciasta 48
sok pędu sok mleczny 17
wygląd łodygi łodyga gałęzista 701
wygląd łodygi łodyga szorstka 108
wygląd łodygi łodyga owłosiona 670
wygląd łodygi łodyga żebrowana 8
wygląd łodygi łodyga omszona 52
wygląd łodygi łodyga gładka 364
wygląd łodygi łodyga kolczasta 14
wygląd łodygi łodyga wzniesiona 607
wygląd łodygi łodyga pełzająca 220
wygląd łodygi łodyga trójkanciasta 47
wygląd łodygi łodyga czterokanciasta 69
szacowana wysokość łodygi od kolana do pasa (60 < x < 100 cm) 371
szacowana wysokość łodygi od pasa do wysokości człowieka (100 < x < 200 cm) 234
szacowana wysokość łodygi wyższa od człowieka (> 200 cm) 270
szacowana wysokość łodygi do kostki (0 < x < 15 cm) 126
szacowana wysokość łodygi od kostki do kolana (15< x <60 cm) 9
zapach łodygi zapach czosnkowy 2
zapach łodygi zapach nieprzyjemny 10
zapach łodygi zapach aromatyczny 19
pora kwitnienia styczeń 1
pora kwitnienia luty 9
pora kwitnienia marzec 67
pora kwitnienia kwiecień 229
pora kwitnienia maj 623
pora kwitnienia czerwiec 1036
pora kwitnienia lipiec 1130
pora kwitnienia sierpień 889
pora kwitnienia wrzesień 453
pora kwitnienia październik 134
pora kwitnienia listopad 8
pora kwitnienia grudzień 3
siedlisko Skraje lasów 2
siedlisko Widne lasy, zarośla i zręby 2
siedlisko Dąbrowy 1
siedlisko Wrzosowiska 1
siedlisko Gleby suche i piaszczyste 1
siedlisko Bory mieszane 1
siedlisko Brzegi wód 2
siedlisko Tereny podmokłe i zabagnione 1
siedlisko Regiel dolny 1
siedlisko Lasy liściaste 1
siedlisko Regiel górny 2
siedlisko Polany leśne 1
siedlisko Wilgotne pola i przydroża 1
siedlisko Mokre łąki, pastwiska i miedze 1
siedlisko Słoneczne łąki i murawy 1
inne cechy szyszek opadają w całości 1
kolor szyszek jasnobrązowe 1
kształt szyszki gładkie 1
ułożenie szyszek zwisające 1
wielkość szyszek 10-15 cm 1

Aktualizacja bazy danych

Korzystając z powyżej przedstawionego schematu, robot sprawdza co tydzień czy pojawiły się nowe rośliny w polskiej Wikipedii oraz czy obecne już w naszej bazie rośliny nie zostały zaktualizowane - jeśli tak, nanosi poprawki w atlasie.

Jak wynika z powyższego opisu, by uaktualnić bazę atlasu należy uaktualnić polską Wikipedię. Zachęcamy do samodzielnego dodawania artykułów o polskich roślinach (można to zrobić bez zakładania konta) - nie tylko wzbogacisz Wikipedię, ale jednocześnie atlas. Oczywiście Wikipedia (czy bardziej ogólnie - Wikimedia) umożliwia również dodawanie zdjęć roślin.

Jeśli jesteś zainteresowana/y dodaniem nowych roślin do Wikipedii, poniżej przygotowaliśmy spis pozycji, które prawdopodobnie występują w Polsce, ale nie występują w Wikipedii:

Warto pamiętać, że polscy Wikipedyści tworzą artykuły dotyczące roślin według pewnego schematu, który jest opisany tutaj.

Jeśli brakuje w atlasie rośliny, która jest obecna w Wikipedii, możesz albo nam o tym napisać, albo uzupełnić któryś z poniższych spisów roślin w Wikipedii:

Rozpoznawanie roślin na podstawie zdjęć

Rozpoznawanie wykorzystuje sieć neuronową resnet 101 wytrenowaną na podstawie zdjęć z atlasu za pomocą mxnet. Model można pobrać tutaj (licencja GPL).

Dokładność algorytmu rozpoznawania roślin na podstawie zdjęcia*:

w 77%przypadków roślina ze zdjęcia pojawia sięjako pierwsza na liście wyników
w 91%w pierwszej piątce
* - wyniki dla 25642 losowych, ogólnodostępnych w internecie zdjęć roślin, po wyłączeniu zdjęć użytych do trenowania sieci neuronowej (validation set, dlatego w rzeczywistości dokładność będzie nieznacznie mniejsza)

Licencja

Zawartość atlasu udostępniana jest na zasadach licencji Creative Commons BY-SA 3.0, ponieważ pochodzą one z Wikipedii. Zdjęcia natomiast opatrzone są informacją o licencji i autorstwie przy powiększeniu ich do pełnego rozmiaru. Jest to zazwyczaj licencja z rodziny Creative Commons lub domena publiczna. Jeśli Twoje zdjęcie znalazło się tu wbrew licencji, zgłoś to nam korzystając z przycisku Zgłoś błąd po prawej stronie okna.

Kod źródłowy

Kod źródłowy atlasu roślin jak i aplikacji na telefony mobilne można pobrać z repozytorium. Kod udostępniany jest na wolnej licencji GPL.